Всесторонний анализ однонуклеотидных вариантов и альтернативного полиаденилирования у инбредных и аутбредных свиней

Печать

Всесторонний анализ однонуклеотидных вариантов и альтернативного полиаденилирования у инбредных и аутбредных свиней

Инбридинг, или близкородственное скрещивание, представляет собой важный аспект разведения животных, который может оказывать значительное влияние на генетическое разнообразие и фенотипические характеристики потомства. В свиноводстве инбридинг часто применяется для закрепления желаемых признаков, однако он также может привести к нежелательным последствиям, таким как накопление гомозиготных однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в геноме. Это исследование фокусируется на свиньях породы Лучуань и анализирует, как инбридинг влияет на выбор альтернативных сайтов полиаденилирования (APA) и связанные с этим генетические механизмы.

Инбридинг и его последствия

Инбридинг приводит к повышению гомозиготности, что означает, что особи имеют две одинаковые копии определенного гена. Это может быть как положительным, так и отрицательным фактором. С одной стороны, инбридинг может помочь зафиксировать полезные признаки, такие как высокая продуктивность или устойчивость к болезням. С другой стороны, он может привести к накоплению вредных аллелей и снижению репродуктивной способности, а также ухудшению физиологических функций у потомства.

Гомозиготные SNP и их влияние на экспрессию генов

В ходе нашего исследования мы провели повторное секвенирование генома свиней породы Лучуань, чтобы выявить уровень накопления гомозиготных SNP. Результаты показали, что инбридинг приводит к значительному увеличению количества таких полиморфизмов. Эти изменения могут существенно повлиять на экспрессию генов, что, в свою очередь, отражается на фенотипических характеристиках животных.

Альтернативные сайты полиаденилирования (APA)

Альтернативные сайты полиаденилирования (APA) играют важную роль в регуляции экспрессии генов. Они могут влиять на стабильность мРНК и, следовательно, на уровень белка, который будет синтезирован. В нашем исследовании мы провели секвенирование 3-мРНК в различных тканях, таких как мышцы ног, подчелюстные лимфатические узлы и ткани печени, чтобы определить различия в экспрессии APA между инбредными и аутбредными свиньями.

Результаты показали, что инбридинг приводит к значительным изменениям в экспрессии APA в разных тканях. Эти изменения были связаны с различными биологическими процессами, что подчеркивает важность учета генетической структуры при изучении фенотипических проявлений.

Роль SNP сигналов полиаденилирования (PAS)

Мы также исследовали роль SNP сигналов полиаденилирования (PAS) в регуляции APA при инбридинге. В ходе анализа были идентифицированы ключевые гены, такие как PUM1, SCARF1, RIPOR2, C1D и LRRK2, которые играют важную роль в регуляции биологических процессов. Эти гены могут влиять на различные аспекты физиологии свиней, включая рост, развитие и устойчивость к заболеваниям.

Данное исследование предоставляет новые ресурсы и понимание влияния геномной гомозиготности на регуляцию APA у свиней породы Лучуань. Понимание генетических характеристик и биологических процессов, связанных с инбридингом, может помочь в разработке более эффективных стратегий разведения, направленных на улучшение здоровья и продуктивности животных. Важно учитывать как положительные, так и отрицательные последствия инбридинга для достижения оптимального баланса в селекционном процессе.

Источник:  International Journal of Biological Macromolecules


Печать
25
18.10.2024

Племенные животные

Крупная Белая

Крупная Белая – свиноматка чистой линии. Свиноматки и потомство этой линии отличаются жизнестойкостью и выносливостью. В произв...

Свинка F1 генетики Genesus

Материнские породы, характеризующаяся высоким многоплодием, великолепной молочностью и хорошей выживаемостью поросят, характери...

Дюрок – Jersey Red Duroc

Красный Дюрок из Джерси – постоянно лидирует в дегустационных тестах по всему миру.  Существует только одна порода св...

Родительская свиноматка ТN70

Родительская свиноматка ТN70 – результат скрещивания Топигс Крупная Белая и НорсвинЛандрас. Это первый совместный  пр...

TN Tempo

Потомство хряка Темпо отличается жизнеспособностью и отличной конверсией корма, а также демонстрирует быстрые темпы роста. Выно...

Все племенные животные

Статьи партнеров

Инфекционные заболевания свиней представляют собой серьезную угрозу для здоровья животных и экономики сельского хозяйства. Понимание этапов развития з...

185

Контроль микроклимата на свиноводческих фермах в осенний период — это не просто вопрос комфорта свиней, но и залог успешного ведения бизнеса. Учитывая...

256

Выбор комбикорма – это не просто вопрос экономии. Это инвестиция в здоровье и продуктивность ваших животных, а значит, и в будущее вашего хозяйства. Н...

352

На нескольких свиноводческих комплексах мы провели эксперимент, в ходе которого наблюдали за ростом и развитием поросят в течение 45 дней. Этот период...

395

Основной целью данного продукта является снижение стресса (в том числе транспортного, ветеринарного, кормового и предубойного), случаев канниб...

438

Профилактика микотоксикоза свиней должна быть частью стратегии управления здоровьем на ферме. Регулярное применение КЛИНОФИД поможет минимизировать ри...

325

Свиноводство является одним из ключевых направлений сельского хозяйства в России. Оно обеспечивает страну не только мясной продукцией, но и сырьем для пищевой промышленности. Усо...

333

Выявление рисков, связанных с микотоксинами, является критически важным аспектом в кормлении животных, особенно в свиноводстве. Микотоксины — это токс...

866

Включение в рацион свиней Proviox 50 - это обеспечение гарантированной антиоксидантной активности, улучшение обмена веществ и качества мяса, а также э...

570

Свиноводческие комплексы требуют особого подхода к выбору строительных материалов и оборудования. Одним из ключевых элементов, влияющих на эффективнос...

587

Лето в самом разгаре! Как и прогнозировали синоптики, температура воздуха часто превышает норму, а значит, нужно уделять больше внимания содержанию и ...

563